La Direction Générale des Services Pénitentiaires a été instituée pour la première fois dans l’organigramme du ministère en charge de la Justice par le décret n° 12.131 du 12 juin 2012. Elle a été reconduite en 5 novembre 2016 par le décret n° 16.379 comme la réponse phare aux préoccupations exprimées par les Etats généraux de la Justice. Le Magistrat Flammarion Goba la dirige depuis le 12 janvier 2017.